乳酸桿菌(LB)核酸檢測試劑盒(PCR-熒光探針法)
規(guī)格:50次
價格:5860元
產(chǎn)品及特點
乳酸桿菌是可使葡萄糖等糖類分解為乳酸的各種細的總稱。乳酸菌是一種無芽孢
的桿菌,屬革蘭氏陽性菌,厭氧性呼吸。廣泛分布于自然界,有些菌株是人和動物口
腔、腸道及道的正常菌群之一,很少致病,除極偶爾引起亞急性細性心內(nèi)膜炎外,
對人基本無害。寄生于口腔的乳酸桿菌在齲齒發(fā)生中起重要作用。一般認為寄生于腸
道和道的乳酸桿菌對機體有保護作用某些乳桿菌如嗜酸性乳桿菌、保加利亞乳桿菌,
常用于飲料的發(fā)酵工業(yè)。本公司開發(fā)乳酸桿菌屬通用染料法熒光定量 PCR 試劑盒,它
具有下列特點:
1. 即開即用,用戶只需要提供 DNA 模板。
2. 引物根據(jù)乳酸桿菌屬專一區(qū)設計,特異性高。
3. 熒光定量 PCR 檢測,比常規(guī) PCR 更加靈敏。
4. 一管式閉管操作,降低了交叉污染。
5. 本試劑盒足夠 50 次 20μL 反應體系的熒光定量 PCR。
6. 本產(chǎn)品只適用于科研,不能用于臨床診斷。
乳酸桿菌屬通用染料法熒光定量PCR試劑盒規(guī)格及成分
成分
|
編號
|
十孔盒包裝
|
2×qPCR MagicMix
|
A
|
500μL(棕色管)
|
熒光 PCR 專用模板稀釋液
|
|
1 mL(黃蓋)
|
乳酸桿菌屬通用PCR 引物混合物
|
C
|
100μL(白蓋)
|
乳酸桿菌屬通用 PCR 陽性對照(1×10E8 拷貝/μL)
|
D
|
50μL(紅蓋)
|
DNA 病毒裂解液(試用裝)
|
E
|
15 次(9 mL)
|
使用手冊
|
F
|
1 份
|
運輸及保存: 低溫運輸,-20℃保存,有效期一年。
自備試劑:DNA 模板、10×ROX(根據(jù)機型決定,具體見使用方法)。
乳酸桿菌屬通用染料法熒光定量PCR試劑盒使用方法
一、稀釋 PCR 陽性對照(以 10E2-10E7 拷貝/μL 這 6 個 10 倍稀釋度為例)
1. 注意:由于標準品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區(qū)域進行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴散傳染性病原,本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對照,只提供可以直接使用的 DNA 片段作為陽性對照。
2. 標記 6 個離心管,分別為 7,6,5,4,3,2。
3. 用帶芯槍頭分別加入 45 μL 熒光 PCR 專用模板稀釋液(*好用帶芯槍頭,下同)。
4. 在 7 號管中加入 5 μL 1×10E8 拷貝/μL 的陽性對照,充分震蕩 1 分鐘,得1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照。放冰上待用。
5. 換槍頭,在 6 號管中加入 5 μL 1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照。放冰上待用。
6. 換槍頭,在 5 號管中加入 5 μL 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照到 5 號管中,充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E5 拷貝/μL 的陽性對照。放冰上待用。
7. 重復上面的操作直到得到 6 個稀釋度的陽性對照。放冰上待用。
二、樣品DNA的制備
8. 如果有N個樣品,必須設置N+2個提取,多出的一個是PC(樣品制備陽性對照),一個是NC(樣品制備陰性對照)。可以用 10μL上步制備的PCR 陽性對照的第4號(濃度為 1×10E4 拷貝/μL,10μL相當于1萬拷貝)或第5號(濃度為1×10E5拷貝/μL,10μL 相當于10萬拷貝)再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求的體積一樣,以此作為PC。另外用水作為NC。如果每次制備需要200μL樣品,則PC和NC的體積也必須是200μL。
9. 用自選方法純化樣品的DNA,本試劑盒跟市場上大多數(shù)病毒DNA提取試劑盒兼容。也可以選購本公司的一管式病毒DNAout 或其升級版柱式病毒DNAout。本試劑盒免費贈送15次一管式病毒DNAout。
三、設置qPCR反應(20μL體系,在樣品制備室進行)
10. 如果只做1次重復,則標記N+9個PCR管,其中N+2個用于上步得到的N+2個
樣品,1個用于PCR陰性對照,6個用于PCR陽性對照。如果做2-3次重復,則反應設置數(shù)量相應增加2或3倍。
11. 在標記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復。樣品管和陰性對照設置完畢后才設置陽性對照,并且陽性對照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲存好后*后加):
成分
|
樣品管
N+2 個
|
PCR 陰性
對照管
|
PCR 陽性
對照管(2-7 管)
|
2×qPCR MagicMix
(棕色管)
|
10 μL
|
10 μL
|
各 10 μL
|
乳酸桿菌屬通用 PCR
引物混合液(白蓋)
|
2 μL
|
2 μL
|
各2 μL
|
自備 10×ROX (見注)
|
2 μL
|
2 μL
|
2 μL
|
N+2 待測樣品 DNA 模板
|
6 μL
|
不加
|
不加
|
第 7 步所得 PCR 陽性對照稀釋液(2-7 號)
|
不加
|
不加
|
各 6μL(2 號樣到
2 號管,3 號樣到 3
號管…)
|
注:僅 ABI7500、7700 和 7900 儀器需要使用 ROX 作為對照,其他熒光PCR儀器(如 iCycler IQ、MJ Option、MJ Chromo4、MX3000、MX4000、RotorGene3000、RotorGene 6000 和 LightCycler480)不需要使用 ROX,則用水替代。
12. 蓋上蓋子后上機,按下面參數(shù)進行PCR(具體PCR參數(shù)可以根據(jù)儀器不同而自行優(yōu)化)。
過程
|
溫度
|
時間
|
預變性
|
92℃
|
5 分鐘
|
PCR 反應(35 個循環(huán))
|
94℃
|
60 秒
|
50℃
|
60 秒
|
72℃
|
60 秒
|
13. 數(shù)據(jù)采集
具體操作按所用儀器推薦的流程進行。本產(chǎn)品中所含的熒光染料在不結合 DNA 時,*大吸收光譜在 471 nm,結合 DNA 時的*大吸收光譜在 500 nm,*大發(fā)射光譜在 530 nm。信號采集可以設置在復性或延伸步驟。
四、數(shù)據(jù)處理
14. 如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的 log 值為橫軸,以 Ct 值為縱軸,繪制標準曲線。再以待測樣品的 Ct 值從標準曲線上推算出樣品 DNA 濃度的log 值,再推算出其濃度。
15. 如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照 Ct 必須大于或等于 40。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長,有典型擴增曲線,Ct 值應該小于或等于30。對待測樣品,如果其 Ct 大于或等于 40 則為陰性,如果小于或等于 35 則為陽性。如果在 35-40 之間,則重復一次。重復實驗的 Ct 值如果大于或等于 40 則為陰性,如果小于 40,則為陽性。
五、熒光定量PCR技術的基礎理論:
1、熒光定量PCR線性關系成立的條件分析 、熒光定量PCR線性關系成立的條件分析。
左圖橫坐標是PCR循環(huán)次數(shù),縱坐標是總的熒光強度Rn,改圖反映的是各個樣品隨著 左圖橫坐標是PCR循環(huán)次數(shù),縱坐標是總的熒光強度Rn,改圖反映的是各個樣品隨著 每輪PCR反應,其總的熒光量的實時變化;右圖橫坐標也是PCR循環(huán)次數(shù),縱坐標是 每輪PCR反應,其總的熒光量的實時變化;右圖橫坐標也是PCR循環(huán)次數(shù),縱坐標是 總的熒光強度與熒光本底的差值RT RB即△Rn的對數(shù),在右圖中確定閾值線,該直 總的熒光強度與熒光本底的差值RT –RB即△Rn的對數(shù),在右圖中確定閾值線,該直 線上所有樣品的RT RB的對數(shù)都相同,熒光定量PCR的線性關系才會成立。 線上所有樣品的RT –RB的對數(shù)都相同,熒光定量PCR的線性關系才會成立。