DNA合成儀的操作步驟
DNA合成儀的操作步驟
以亞磷酰胺寡核苷酸的合成為例,介紹該類儀器的一般操作步驟。亞磷酰胺DNA合成試劑包括:5/-DMT保護堿基,A、G、C、T的亞磷酰胺單體,四唑偶聯(lián)催化劑,醋 酸 酐,N-甲基咪唑封閉劑,三***(TCA)脫保護液,12氧化混合物、乙腈清洗溶劑、除氨溶液。使用步驟如下:
1)仔細檢查合成儀上所有試劑瓶的試劑量,必要時更換試劑瓶,特別注意乙腈的量,因為溶劑量比較大。
2) 將標記好的干凈收集瓶放在合成器上。
3) 將要合成的DNA序列輸入合成儀。
4) 檢查選擇的合成步驟是否正確。
5) 選擇結束方式:TritylOffAuto 為儀器的原始狀態(tài)。如果您打算將純化的寡核苷酸與 5-DMT 基團連接,請將其更改為 TritylOnAuto 的結束狀態(tài)。
6)選擇結束方式,一般是系統(tǒng)的原始狀態(tài)。
7) 在每個列監(jiān)視器的用戶名下,輸入要保存的名稱。
8) 用代碼代替相應的 DNA 序列標記每個收集瓶。
9) 打印出每列設置的詳細信息。
10) 檢查打印信息是否正確。
11) 運行StartColumn 步驟,檢查每一列的位置,確保合成器上的合成列處于正確位置。
12)檢查與合成器相連的溶劑殘留物(廢液瓶)是否已滿。
13)如果使用部分收集器收集DMT各脫保護步驟的流出物,確保試管足夠干凈,打開部分收集器,確保DMT廢液管線通向部分收集器。
14) 啟動循環(huán),運行啟動程序,清洗試劑管路,取出原試劑。
注:TritylOnAuto 表示合成寡核苷酸的5端有一個DMT,從固體載體上切下,保存在收集瓶中; TritylOffAuto 表示合成寡核苷酸 5. 末端核苷酸無保護基團,從固體載體上切下,保存在收集瓶中; TritylOnManual是指合成寡核苷酸的5末端核苷酸有DMT,寡核苷酸沒有從固體載體上切下來,但保存在合成柱中; TritylOffManual是指在合成寡核苷酸的5中,末端核苷酸沒有保護基團,寡核苷酸沒有從固相支持物上切斷,而是留在合成柱中