常用的RNA酶抑制劑：

1. 焦磷酸二乙酯（DEPC）：是一種強烈但不徹底的RNA酶抑制劑。它通過和RNA酶的活性基團組氨酸的咪唑環(huán)結(jié)合使蛋白質(zhì)變性，從而抑制酶的活性。

2. 異硫氰酸胍：目前被認為是有效的RNA酶抑制劑，它在裂解組織的同時也使RNA酶失活。它既可破壞細胞結(jié)構(gòu)使核酸從核蛋白中解離出來，又對RNA酶有強烈的變性作用。

3. 氧釩核糖核苷復合物：由氧化釩離子和核苷形成的復合物，它和RNA酶結(jié)合形成過渡態(tài)類物質(zhì)，幾乎能完全抑制RNA酶的活性。

4. RNA酶的蛋白抑制劑（RNasin）：從大鼠肝或人胎盤中提取得來的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一種非競爭性抑制劑，可以和多種RNA酶結(jié)合，使其失活。

5. 其它：SDS、尿素、硅藻土等對RNA酶也有一定抑制作用。

因為DEPc不加選擇的修飾蛋白質(zhì)和RNA，因此在分離和純化RNA過程中不能使用，而且它與一些緩沖液(例如Tri)不能相容，在所有RNA實驗中，關(guān)鍵的因素是分離得到全長的RNA。而實驗失敗的主要原因是核糖核酸酶（RNA酶）的污染。RNA酶可耐受多種處理而不被滅活，如煮沸。

 研究人員造成的污染 RNA酶主要的潛在污染源是研究人員的手。因此進行RNA實驗時應勤換手套。

然而DEPC能與胺和巰基反應,所以含Tris和DTT的試劑不能用DEPC處理。