在生物學(xué)迅速發(fā)展的今天,凝膠電泳作為主要的科研實(shí)驗(yàn)手段早已被廣泛應(yīng)用于核酸和蛋白的分離,而電泳圖像的獲取和相關(guān)分析主要依靠凝膠成像系統(tǒng)。凝膠成像即對DNA/RNA/蛋白質(zhì)等凝膠電泳不同染色(如EB、考馬氏亮藍(lán)、銀染、Sybr Green)及微孔板、平皿等非化學(xué)發(fā)光成像檢測分析。凝膠成像系統(tǒng)可以應(yīng)用于分子量計(jì)算,密度掃描,密度定量, PCR定量等生物工程常規(guī)研究。
凝膠成像應(yīng)用范圍
總體上來說凝膠成像可應(yīng)用于:凝膠成像系統(tǒng)可以用于:蛋白質(zhì)、核酸、多肽、氨基酸、多聚氨基酸等其他生物分子的分離純化結(jié)果作定性分析。
(1)分子量定量對于一般常用的DNA膠片,利用分子量定量功能,通過對膠上DNA Marker條帶的已知分子量注釋,自動(dòng)生成擬合曲線,并以它衡量得到未知條帶的分子量。通過這種方法所得到的結(jié)果較肉眼觀察估計(jì)要準(zhǔn)確很多。
(2)密度定量
一般常用的測定DNA(脫氧核糖核酸)和RNA(核糖核酸)濃度的方法是紫外吸收法,但它只能測定樣品中的總核苷酸濃度,而不能區(qū)分各個(gè)長度片段的濃度。利用凝膠成像系統(tǒng)和軟件,先將DNA膠片上某一已知其DNA含量的標(biāo)準(zhǔn)條帶進(jìn)行密度標(biāo)定以后,可以方便的單擊其他未知條帶,根據(jù)與已知條帶的密度做比較,可以得到未知DNA的含量。此方法也適用于對PA GE蛋白膠條帶的濃度測定。 備注:聚丙烯酰胺凝膠電泳PAGE
(3)密度掃描
在分子生物學(xué)和生物工程研究中,*常用到的是對蛋白表達(dá)產(chǎn)物占整個(gè)菌體蛋白的百分含量的計(jì)算。傳統(tǒng)的方法是利用專用的密度掃描,但利用生物分析軟件結(jié)合現(xiàn)在實(shí)驗(yàn)室常規(guī)配備的掃描儀或者直接用白光照射的凝膠成像就能完成此項(xiàng)工作。
(4)PCR定量
PCR定量主要是指,如果PCR實(shí)驗(yàn)擴(kuò)增出來的條帶不是一條,那么可以利用軟件計(jì)算出各個(gè)條帶占總體條帶的相對百分?jǐn)?shù)。就此功能而言,與密度掃描類似,但實(shí)際在原理上并不相同。PCR定量是對選定的幾條帶進(jìn)行相對密度定量并計(jì)算其占總和的百分?jǐn)?shù),密度掃描時(shí)并對選擇區(qū)域生成縱向掃描曲線圖并積分。
凝膠成像種類
(1)普通凝膠成像分析系統(tǒng):可以對蛋白電泳凝膠,DNA凝膠樣品進(jìn)行圖象采集并進(jìn)行定性和定量分析,樣品包括:EB、SYBR Green、SYBR Gold、Texas Red、GelStar、Fluoroscecin、 Radiant Red等染色的核酸監(jiān)測;以及Coomassie Blue、SYPRO Orange、各種染色的蛋白質(zhì)凝膠如考染等。(或UV,EB和有色及可見樣品成像);
(2)化學(xué)發(fā)光成像分析系統(tǒng):成像范圍涵蓋UV,EB,化學(xué)發(fā)光、紫外-熒光、有色及可見樣品成像;
(3)多色熒光成像分析系統(tǒng):成像范圍涵蓋UV,EB,化學(xué)發(fā)光、多色熒光熒光、有色及可見樣品成像;
(4)多功能活體成像分析系統(tǒng):UV,EB,化學(xué)發(fā)光、多色熒光熒光、有色及可見樣品成像和離體組織和小型動(dòng)物,及大型型動(dòng)物。