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如何預(yù)防PCR實(shí)驗(yàn)污染

    試劑配制區(qū)、樣品處理區(qū)、核酸擴(kuò)增區(qū)和產(chǎn)物分析室的順序,依次來(lái)說(shuō)說(shuō)哪些問(wèn)題需要重點(diǎn)盯防。

試劑配制區(qū)

    試劑配置區(qū),看上去很簡(jiǎn)單,操作也很重復(fù)。如果在試劑配制階段,就產(chǎn)生污染的話(huà),預(yù)示著實(shí)驗(yàn)員將完整地浪費(fèi)一次實(shí)驗(yàn)時(shí)間。

    所以,在試劑配置區(qū),移液工具和溶液都要定期**。

    槍頭要及時(shí)更換

    試劑管的蓋子要及時(shí)蓋上

    不管有沒(méi)有可疑的污染源,在試劑配置區(qū),都要定期檢查污染情況,這樣才能及時(shí)發(fā)現(xiàn)問(wèn)題所在。

核酸提取區(qū)

     實(shí)驗(yàn)員常用的核酸提取,就是用商品化核酸提取試劑盒來(lái)手工提取。而且在這個(gè)過(guò)程中,要涉及到多次加液、轉(zhuǎn)移、離心操作,可謂是雷點(diǎn)重重。

     在核酸提取中,試劑通常會(huì)存在有機(jī)組分,會(huì)產(chǎn)生漏液滴液現(xiàn)象。

     而離心過(guò)程中,樣品里的**、細(xì)胞、血液之流,還有可能隨著離心機(jī),變成氣溶膠,在空氣中四處飄蕩,威脅著生物民工的生命**。

    當(dāng)實(shí)驗(yàn)室充滿(mǎn)了危險(xiǎn)物質(zhì)和污染源的時(shí)候,大咖選擇另開(kāi)一個(gè)樓層,重建一個(gè)實(shí)驗(yàn)室。而普通實(shí)驗(yàn)員該怎么做呢?

加液和移液時(shí)

    升級(jí)移液技術(shù),就能有效地防止在加液和移液時(shí),發(fā)生滴液、漏液,進(jìn)而污染工作臺(tái)和其他樣本。比如移取含揮發(fā)性有機(jī)溶液的試劑時(shí),我們可以進(jìn)行預(yù)潤(rùn)洗或者更換適配性好的吸頭。

    另外,把移液器換成分液器能顯著地改善滴液漏液的情況。

離心時(shí)

    當(dāng)小心翼翼地安置好試劑,等待離心結(jié)束,期待滿(mǎn)滿(mǎn)地打開(kāi)離心機(jī)蓋子的時(shí)候,卻發(fā)現(xiàn)一個(gè)破碎的離心管,整個(gè)畫(huà)面真是令人心碎。

    離心管破碎,免不了又開(kāi)始洗洗洗

    因此離心的時(shí)候,還是要選擇質(zhì)量可靠的離心管。



    而藏污納垢重災(zāi)區(qū)之一——離心機(jī)的轉(zhuǎn)子和吊籃,也要選擇便于高溫****的那種,這樣,就可以節(jié)約很多**清潔的時(shí)間啦。

實(shí)驗(yàn)全程控制

     在實(shí)驗(yàn)的過(guò)程中,增加空白提取對(duì)照或陰性樣本提取對(duì)照,對(duì)核酸提取過(guò)程和實(shí)驗(yàn)環(huán)境進(jìn)行控制。

核酸擴(kuò)增區(qū)和產(chǎn)物分析區(qū)

    這兩個(gè)區(qū)域涉及 PCR 實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)備、運(yùn)行以及 PCR 產(chǎn)物的分析。PCR 實(shí)驗(yàn)因?yàn)槭置舾卸鴤涫軞g迎,不過(guò)這個(gè)敏感的優(yōu)勢(shì),也同樣放大了污染。極其微量的污染,就可能反手摔一個(gè)假陽(yáng)性結(jié)果給你。

     而且 PCR 實(shí)驗(yàn)中,運(yùn)行中的電泳池附近,會(huì)有大量 DNA 擴(kuò)散,一旦出現(xiàn)氣溶膠污染,就真是又要關(guān)閉實(shí)驗(yàn)室了。

在這個(gè)區(qū)域當(dāng)中,主要的污染集中在 3 個(gè)地方:


模板間交叉污染:

    主要是在取樣加樣的過(guò)程中,由于移液器之間的交叉形成的污染。

    移液器所造成的污染,如果是表面的話(huà)可以經(jīng)常使用 70% 的酒精進(jìn)行擦拭,而內(nèi)部造成的污染,因?yàn)?*清潔比較困難,所以選用集吸液放液脫卸吸頭于一鍵的移液器。

    吸頭中的濾芯,也能夠阻止氣溶膠擴(kuò)散,防止污染的產(chǎn)生.



PCR 試劑的污染:

主要是在 PCR 組分試劑加樣過(guò)程中,由于移液器、容器、陰性對(duì)照及其它試劑被核酸模板或陽(yáng)性對(duì)照污染。  

加樣過(guò)程中,因?yàn)?PCR 試劑對(duì)溫度十分敏感,需要通過(guò)冰浴使得 PCR 試劑和 PCR 板/管處于 0℃,但這個(gè)過(guò)程也是充滿(mǎn)了污染的風(fēng)險(xiǎn)的。

而改用 PCR-Cooler 低溫指示冰盒和 IsoTherm-System 冰盒系統(tǒng),就可以不用再通過(guò)冰浴避免污染風(fēng)險(xiǎn),樣品和試劑的**了。

PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物污染:

這是 PCR 反應(yīng)中主要常見(jiàn)的污染問(wèn)題。因?yàn)?PCR 產(chǎn)物拷貝量大,遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于 PCR 檢測(cè)數(shù)個(gè)拷貝的極限,所以極微量的 PCR 產(chǎn)物污染,就可形成假陽(yáng)性。

每一項(xiàng)準(zhǔn)備工作沒(méi)有做好,都會(huì)影響到擴(kuò)增產(chǎn)物區(qū),因此,想要順利地出結(jié)果,文中提到的注意點(diǎn),都要小心謹(jǐn)慎地對(duì)待。

另外,降低 PCR 實(shí)驗(yàn)的頻率也能降低被污染的風(fēng)險(xiǎn)。能一次做 50 個(gè),不要分開(kāi) 5 次每次做 10 個(gè)。不用頻繁做 PCR 實(shí)驗(yàn),實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)也更好看。

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