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產品資料

鵝細小病毒PCR檢測試劑盒

鵝細小病毒PCR檢測試劑盒
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  • 產品名稱:鵝細小病毒PCR檢測試劑盒
  • 產品型號:
  • 產品展商:信裕生物
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簡單介紹
鵝細小病毒PCR檢測試劑盒適用于檢測疑似感染者或發(fā)病動物等組織、體液或**結等標本中禽流感病毒rna,用于禽流感病毒感染的輔助診斷,鵝細小病毒PCR檢測試劑盒特點優(yōu)勢:1.特異性高、2.重現(xiàn)性好、3.靈敏性強、4.實用性好,廠家現(xiàn)貨促銷。
產品描述


鵝細小病毒PCR檢測試劑盒PCR反應程序

1.常規(guī)程序

PCR反應所需的成分配置完后,在PCR儀上于94-96℃預加熱幾十秒至幾分鐘,使模板DNA充分變性,然后進入擴增循環(huán)。在每一個循環(huán)中,先于94℃保持30秒鐘使模板變性,然后將溫度降到復性溫度(一般50-60℃之間),一般保持30秒鐘,使引物與模板充分退火;在72℃保持1分鐘(擴增1kb片段),使引物在模板上延伸,合成DNA,完成一個循環(huán)。重復這樣的循環(huán)2535次,使擴增的DNA片段大量累積。*后,在72℃保持3-7min,使產物延伸完整,4℃保存。

2.復性(退火)和延伸溫度

復性的溫度是PCR擴增是否順利的關鍵因素,通常在50-60℃之間。具體的溫度主要由引物的Tm值決定。延伸溫度絕大多數設定為72℃。如果復性的溫度很高,可以將延伸溫度和復性溫度設置成同一溫度,變成二步法PCR

3.反應時間

變性步驟一般使用30秒鐘,如果模板的G+C含量較高,或直接用細胞做模板,變性時間可適當延長。復性時間有30秒種一般是足夠的。延伸時間由擴增產物的大小決定,一般采用1kb1分鐘來保證充足的時間。

4.循環(huán)次數

循環(huán)次數主要與模板的起始數量有關,在模板拷貝數為104105數量級時,循環(huán)數通常為2535次。

平臺效應(plateaueffect):PCR擴增過程后期會出現(xiàn)的產物的積累按減弱的指數速率增長的現(xiàn)象。原因:底物和引物的濃度已經降低,dNTPDNA聚合酶的穩(wěn)定性或活性降低,產生的焦磷酸會出現(xiàn)末端產物抑制作用,非特異性產物或引物的二聚體出現(xiàn)非特異性競爭作用,擴增產物自身復性,高濃度擴增產物變性不徹底。

5.PCR反應液的配制

PCR反應體系的配置方式有時也會影響反應的正常進行。常規(guī)方法與其它酶學反應一樣,在*后加入DNA聚合酶。早期的PCR儀沒有帶加熱的蓋子,要求在反應液上覆蓋一層礦物油,防止水分蒸發(fā)。

對于使用具3-5’外切活性的高溫DNA聚合酶時,有時會擴增不出產物。在遇到這個問題時,如果將反應成分分開配制,A管含模板、引物和dNTP,以及調整體積的H2O,B管含緩沖液、DNA聚合酶和水,然后再將兩管溶液混合起來,可較好地克服這個問題。

按照常規(guī)的方法配制反應體系,有時會出現(xiàn)非特異性擴增的問題。熱啟動(hotstartPCR操作方式可較好解決這一問題。將dNTP、緩沖液,Mg2+primer先配制好,然后加入一粒蠟珠(如AmpliWaxPCRQam100),加熱熔化,再冷卻,使蠟將溶液封住,*后加入模板和DNA聚合酶等剩余成分。只有當PCR反應進入高溫階段后,蠟層熔化,所有反應成分才會混合在一起。

標準的鵝細小病毒PCR檢測試劑盒反應體系:

10×擴增緩沖液 10ul

      4dNTP混合物   各200umol/L

      引物        各10100pmol

      模板DNA 0.12ug

      Taq DNA聚合酶 2.5u

      Mg2+ 1.5mmol/L

      加雙或三蒸水至 100ul

PCR反應五要素

參加PCR反應的物質主要有五種即引物、酶、dNTP、模板和Mg2+引物: 引物是PCR特異性反應的關鍵,PCR 產物的特異性取決于引物與模板DNA互補的程度。理論上,只要知道任何一段模板DNA序列, 就能按其設計互補的寡核苷酸鏈做引物,利用PCR就可將模板DNA在體外大量擴增。

設計引物應遵循以下原則:

①引物長度: 15-30bp,常用為20bp左右。

②引物擴增跨度: 以200-500bp為宜,特定條件下可擴增長至10kb的片段。

③引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC*好隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶  核苷酸的成串排列。

④避免引物內部出現(xiàn)二級結構,避免兩條引物間互補,特別是3'端的互補,否則會形成引物二聚體,產生非特異的擴增條帶。

⑤引物3'端的堿基,特別是*末及倒數**個堿基,應嚴格要求配對,以避免因末端堿基不配對而導致PCR失敗。

⑥引物中有或能加上合適的酶切位點, 被擴增的靶序列*好有適宜的酶切位點, 這對酶切分析或分子克隆很有好處。

⑦引物的特異性:引物應與核酸序列數據庫的其它序列無明顯同源性。引物量: 每條引物的濃度0.11umol10100pmol,以*低引物 量產生所需要的結果為好,引物濃度偏高會引起錯配和非特異性擴增,且可增加引物之間形成二聚體的機會。

酶及其濃度 目前有兩種Taq DNA聚合酶供應, 一種是從棲熱水生桿菌中提純的天然酶,另一種為大腸菌合成的基因工程酶。催化一典型的PCR反應約需酶量2。5U(指總反應體積為100ul),鵝細小病毒PCR檢測試劑盒濃度過高可引起非特異性擴增,濃度過低則合成產物量減少。

dNTP的質量與濃度 dNTP的質量與濃度和PCR擴增效率有密切關系,dNTP粉呈顆粒狀,如保存不當易變性失去生物學活性。dNTP溶液呈酸性,使用時應配成高濃度后,以1M NaOH1M Tris。HCL的緩沖液將其PH調節(jié)到7.07.5,小量分裝, -20℃冰凍保存。多次凍融會使dNTP降解。在PCR反應中,dNTP應為50200umol/L,尤其是注意4dNTP的濃度要相等( 等摩爾配制),如其中任何一種濃度不同于其它幾種時(偏高或偏低),就會引起錯配。濃度過低又會降低PCR產物的產量。dNTP能與Mg2+結合,使游離的Mg2+濃度降低。

模板(靶基因)核酸 模板核酸的量與純化程度,是PCR成敗與否的關鍵環(huán)節(jié)之一,傳統(tǒng)的DNA純化方法通常采用SDS和蛋白酶K來消化處理標本。SDS的主要功能是: 溶解細胞膜上的脂類與蛋白質,因而溶解膜蛋白而破壞細胞膜,并解離細胞中的核蛋白,SDS 還能與蛋白質結合而沉淀; 蛋白酶K能水解消化蛋白質,特別是與DNA結合的組蛋白,再用有機溶劑酚與氯仿抽提掉蛋白質和其它細胞組份,用乙醇或異丙醇沉淀核酸。提取的核酸即可作為模板用于PCR反應。一般臨床檢測標本,可采用快速簡便的方法溶解細胞,裂解病原體,消化除去染色體的蛋白質使靶基因游離,直接用于PCR擴增。RNA模板提取一般采用異硫氰酸胍或蛋白酶K法,要防止RNase降解RNA。

Mg2+濃度 Mg2+PCR擴增的特異性和產量有顯著的影響,在一般的PCR反應中,各種dNTP濃度為200umol/L時,Mg2+濃度為1.52.0mmol/L為宜。Mg2+濃度過高,反應特異性降低,出現(xiàn)非特異擴增,濃度過低會降低Taq DNA聚合酶的活性,使反應產物減少。

鵝細小病毒PCR檢測試劑盒反應條件的選擇

PCR反應條件為溫度、時間和循環(huán)次數。

溫度與時間的設置: 基于PCR原理三步驟而設置變性-退火-延伸三個溫度點。在標準反應中采用三溫度點法,雙鏈DNA9095℃變性,再迅速冷卻至40 60℃,引物退火并結合到靶序列上,然后快速升溫至7075℃,在Taq DNA 聚合酶的作用下,使引物鏈沿模板延伸。對于較短靶基因(長度為100300bp)可采用二溫度點法, 除變性溫度外、退火與延伸溫度可合二為一,一般采用94℃變性,65℃左右退火與延伸(此溫度Taq DNA酶仍有較高的催化活性)。

①變性溫度與時間:變性溫度低,解鏈不完全是導致PCR失敗的*主要原因。一般情況下,93℃~94lmin足以使模板DNA變性,若低于93℃則需延長時間,但溫度不能過高,因為高溫環(huán)境對酶的活性有影響。此步若不能使靶基因模板或PCR產物完全變性,就會導致PCR失敗。

②退火(復性)溫度與時間:退火溫度是影響PCR特異性的較重要因素。變性后溫度快速冷卻至40℃~60℃,可使引物和模板發(fā)生結合。由于模板DNA 比引物復雜得多,引物和模板之間的碰撞結合機會遠遠高于模板互補鏈之間的碰撞。退火溫度與時間,取決于引物的長度、堿基組成及其濃度,還有靶基序列的長度。對于20個核苷酸,G+C含量約50%的引物,55℃為選擇*適退火溫度的起點較為理想。引物的復性溫度可通過以下公式幫助選擇合適的溫度:

Tm(解鏈溫度)=4(G+C)2(A+T)

復性溫度=Tm-(510)

Tm值允許范圍內, 選擇較高的復性溫度可大大減少引物和模板間的非特異性結合, 提高PCR反應的特異性。復性時間一般為3060sec,足以使引物與模板之間完全結合。

③延伸溫度與時間:Taq DNA聚合酶的生物學活性:

7080 150核苷酸/S/酶分子

70 60核苷酸/S/酶分子

55 24核苷酸/S/酶分子

高于90℃時, DNA合成幾乎不能進行。

鵝細小病毒PCR檢測試劑盒反應的延伸溫度一般選擇在7075℃之間,常用溫度為72℃,過高的延伸溫度不利于引物和模板的結合。PCR延伸反應的時間,可根據待擴增片段的長度而定,一般1Kb以內的DNA片段,延伸時間1min是足夠 的。34kb的靶序列需34min;擴增10Kb需延伸至15min。延伸進間過長會導致非特異性擴增帶的出現(xiàn)。對低濃度模板的擴增,延伸時間要稍長些。

循環(huán)次數  循環(huán)次數決定PCR擴增程度。PCR循環(huán)次數主要取決于模板DNA的濃度。一般的循環(huán)次數選在3040次之間,循環(huán)次數越多,非特異性產物的量亦隨之增多。

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